1、从环保和施工性能上比较，防水涂料为水性防水材料，聚氨酯为油性防水材料。水性涂料具有明显优势。首先油性涂料中一般都含有毒害、有异味的挥发物质，同时粘度较大，和易性差，所以比较难施工。其次，油性物质与水的相溶性差。因此对施工的基面干湿度要求类似于卷材产品。而水性材料在上述各方面均优于油性。
2、从材料抗老化性能比较，聚氨酯怕紫外光，因此只能用于隐蔽工程防水，而水泥基类防水涂料大都是采用无机填缝剂和丙烯酸乳配比，故抗老化性能优良。
3、从价格上比较，聚氨酯防水材料要求厚度在1.5-2.0mm每平方材料用量至少2.5-3.0kg，材料用量大，人工成本高，而水泥基类防水材料按照国标要求1.0-1.2mm，用量少，成本低。
4、从施工安全性比较，油性聚氨酯在封闭环境下施工，不但会造成施工人员中毒，同时还会引起爆炸，而作为水性类的水泥基类防水涂料却无此弊端，可放心使用。
5、质量稳定性比较，氨酯涂料一般都是在生产厂家进行反应合成的，其设备性能、工艺控制、原材料等诸多方面可能引起质量差异，特别是一些小型厂家，其条件简陋，员工素质低，因而很难保证品质。而水泥基类涂料属非反应型产品，在工厂只有按配方混合加工即可，故品质稳定性绝对优于聚氨酯类涂料。
6、从涂层外在品质上比较，聚氨酯涂膜表面抗拉强度很低，耐冲击，穿刺等性能很差，而水泥基类涂料一般分刚性和刚柔经济型二种，它们的抗冲击性能优异。在成品保护上远远优于聚氨酯类涂料。
7、从与其它材料配套性能上比较，聚氨酯涂膜层上不可以直接进行粉刷和黏贴瓷砖，而水泥基类涂料却可以直接在其表面进行上述施工。
